《新少林寺》影片的口碑十分两极化，尽管《新少林寺》有刘德华、谢霆锋、范冰冰、成龙、吴京等人鼎力加盟，但依然让很多观众犹豫着到底要不要进电影院去看。看过电影的观众表示，《新少林寺》和老版的《少林寺》其实一点关系都没有。导演陈木胜表示,这仅仅是一部讲少林寺故事的电影，“禅”是《新少林寺》最想表达的主题，可能会让很多依然对老少林寺的观众不适应。据影迷表示，《新少林寺》讲的故事十分惨烈。回忆少林寺里诸位角色的结局和众生的命运，满眼的鲜血淋漓。《新少林寺》故事的重心放在寺外，兄弟尔虞我诈，少林寺内的人物只是陪衬，尤其是众僧舍小我取大义的结局，令观众的情绪趋向悲观。几乎所有的正面角色无一幸存，导演、编剧是为达到某种效果故意为之吗？这样安排他们的命运，是不是过于残忍？
虽然昔日军阀皈依是一条主线，但是他的副将、如今的司令抢去很多戏，让观众很难分清谁是男一号，谁是男二号。谢霆锋卖力表演，表情扭曲，让《新少林寺》更添诡异气氛，大出风头。曹蛮本应衬托佛门的慈悲，但是他每一分钟都好像愤怒的生猛海鲜，失去控制。揭开表面血腥暴力的场面，挥散诡异阴冷的气氛，《新少林寺》似乎没剩下什么。不过首先应该肯定的是，《新少林寺》有一个工整的故事。它讲述了刘德华扮演的大军阀，在经历了手下背叛、妻离女死等一系列惨事后，从一个杀人不眨眼的大魔头，变成了一位一心向佛不愿再造杀孽的和尚。最后更加为救背叛自己的那个人，而牺牲生命。
应该说《新少林寺》是一个关于仇恨以及如何化解仇恨的故事，和老版《少林寺》在立意方面已经有了很大的不同。而据陈木胜导演自己所说，《新少林寺》这部电影其实是先有主旨，后有故事。“少林英雄”在军阀乱世里慈悲为怀、救死扶伤，虽然没有办法去改变世界，但至少给世界带来了一点美好的希望。这就像近两年遭遇很多天灾人祸的现实世界，苦难中总是有很多舍己为人的英雄出现，他们的精神和少林的精神如出一辙。所以从根本上来说，《新少林寺》其实并不是一部单纯的功夫片，或者说它其实就不是一部功夫片。要说它是一部说教片也可以，只不过在陈木胜那里，他在极力让这种说教变得更商业更容易让人接受一点。如果带着看功夫的心理去看这部电影，无疑是要失望的；但如果本来就把它想象成一部寓教于乐的电影，那才会有真正的收获。