1996年7月，王菲窦唯奉子成婚。1997年1月，王菲在北京协和医院产下小童童。两个人为她取名为窦靖童。1998年巡回演唱会，王菲演唱《末日》时，窦唯在背后打鼓，让许多fans激动不已。婚后王菲与窦唯分居北京香港两地，却乐此不疲。然而，王菲并不是爱情这场战争的最终胜利者。可她怎么都没有想到，步入结婚殿堂之后，面对的是更多的彼此忠贞的考验。有一天，本来为了给窦唯一个惊喜的她风尘仆仆地赶回北京的家中，然而，当天的场面让她只有惊没有喜了，推门见到自家床上的一幕让王菲愤恨交加。这直接导致了婚变。所以话说在这场变故中，窦唯虽然属于“有过错一方”，但是他在后来的采访中一直强调“婚变是一场阴谋”。但究竟是怎样，没有人知道其中的内情。
窦唯单方面向外宣布与王菲感情决裂，有分析说，表面的移情别恋背后，是窦唯的心理压力过大。有目共睹的是，歌坛天后王菲无论相貌、才情、地位、财产都比他强出何止百倍，窦唯做这样一位巨星的丈夫，内心压力之大是可想而知。虽然他们是音乐创作上的好拍档，然而人们已经不再留意窦唯的音乐，只知道他是阿菲的男人，或许这种两人之间日益拉大的差距，注定了这场婚姻的结局。在婚变中王菲得到了舆论的同情，其处理的态度得到了一致的赞扬，她始终没有讲过有关窦唯的任何事情，外界评价她“沉默是高贵的”。
沉默的她，唯一做的是彻夜彻夜地狂欢，去跳迪斯科，与朋友痛饮散心。 1999年12月王菲赴北京，两人正式离婚，结束历时3年的婚姻。婚姻结束了，王菲后来开始了新的感情生活，而窦唯却为此付出代价，朋友们说，正是从这次离婚开始，窦唯的性格变得更加内向和孤僻。他从不去人多的地方，也不愿意在人多的地方跟人见面，他在后海的一家酒吧，一待就是3年。最近两年北京南长街的清风茶馆又成了他的固定去处，朋友找他不用打电话，直接去那里，他肯定在。