《最强大脑》第三季将于2016年1月1日21：20登陆江苏卫视[微博]。节目主持人依然是蒋昌建，评审团则由张召忠、郭敬明[微博]、Dr.魏、陶晶莹[微博]组成。新一季也推出了新赛制，常驻评审新增了“爆灯”权力，使得被质疑权力过大的Dr.魏得到了制衡，此外引入TFBOYS、SNH48等深受年轻人喜爱的嘉宾担当“最强出题人”，并且科学团也会针对这些“最强出题人”量身打造出新项目。
评审团有权“爆灯”在前两季，Dr.魏和其他常驻评审之争一直存在，梁冬、高晓松[微博]等评审也遇到过很想通过自己的裁定权，挽留一些选手的情况。比如第一季“盲穿激光线”，在Dr.魏看来却是“因为分解成了单个动作，挑战中选手的记忆难度是不存在的”，最终选手无缘晋级；第二季“爆裂声波”，高晓松与Dr.魏关于该项目的真实性产生争执；在第三季节目中，常驻评审新增了爆灯权力，但只有郭敬明、张召忠、陶晶莹三人同时爆灯才能生效，让有争议的选手复活。节目幕后科学团队主力北京师范大学心理学院院长刘嘉教授介绍，“这样不仅保留了评审权力的合理性，评审之间权力互相制衡，而且减轻了部分观众对Dr。魏权力过大的质疑。”
在第三季，科学团会向大众公开这些基于游戏的智力测评；然而最后真正能够登上舞台的选手却必须是百万里挑一。刘嘉表示，“前两季我们已经设定了一系列多方面能力测试，但是在第三季，我们把这些测试游戏化释放给大众，过五关斩六将海选人才，同时也全民科普。”