武警战士杨灿背负已故父亲遗愿加入特战队，与铁血女教官那敏“针锋相对”，成了特战队另类的“编外兵”。当他旁观一场处突实战后，执意逃跑的杨灿死活留在特战队。在与神枪手赵晓波、侦察尖兵塔西、爆破尖兵老黑、武器小百科马小川、俏丽的心理医生石雨、女汉子教官那敏的朝夕相处中，桀骜不驯的杨灿逐渐定性沉稳。他的智慧和精神打动了战友，并和那敏产生了不一样的情愫。那敏前男友厉剑锋执行完特别任务回到特战队，重又拨起那敏和闺中密友石雨的心弦。杨灿生父林指山出国多年突然归国，异常“关爱”杨灿母亲--电站工程师杨爱萍。在经历潜伏、反劫机、捣毁暴恐分子巢穴等战斗后，杨灿逐渐成熟。他以林指山亲生儿子的身份潜入敌营，与“死而复生”的战友那敏一起摧毁敌人的阴谋，拉开了特战队与暴恐分子的终极战役。
《反恐特战队》看了之后，感受这部剧很好。这部剧的故事好，跟我们过去看到的故事有很大的不同。人物好，再好的故事最终体现在人物身上，最终体现人物精神上。当年有《凯旋在子夜》剧，今天的《反恐特战队》这部剧看点很多，尤其是青年人肯定爱看，从情节到人物都很吸引人。 该剧总体感觉新锐、时尚、阳光、多彩、眩人眼目、荡气回肠，是反恐题材、特种兵题材创作新的收获、新的高度。
该剧一部集特战、命运、感情、性格、悬念于一身。借用戏剧“文武昆乱不挡”的说法，是真正意义上正能量反恐军旅题材的电视剧。而是一部真正不说大话、不说假话，不仅对自己负责、对观众负责、更要对中国军旅负责、对舍小我、成就大我的中国军人负责的军旅电视剧。
这是继《亮剑》以后，又一部张扬军人英雄气概和血性精神的军旅剧。这是一部接近或已经具有“高峰”品质的作品。一部具有标志意义的翘楚之作。《反恐特战队》最激荡人心的地方，是它自始至终的那种“军味”和“战味”。是因为它的故事建立在扎实的生活基础上，不是为了写感情而胡编乱造，而是在扎实的生活基础上挖掘故事。