抗日战争中汪伪政权成立时期，富家少爷明台赴港大读书的途中，被军统高官王天风看中并绑架至军统训练班，经过艰苦特训，成为一名优秀的军统特工。之后明台与生死搭档于曼丽前往上海，展开一系列秘密活动。在“粉碎计划”中，明台与中共地下党成员程锦云联手，成功爆破汪伪政府运送日军高官的专列，二人在战斗中产生了感情。之后，明台暗杀汪伪高官，刺杀日本间谍，屡立奇功。然而明台在一次次行动中，对国民党发“国难财”的举措渐渐心灰意冷，程锦云发展他成为一名中共地下党潜伏工作者。为了获得前方战场的最终胜利，明台与身份复杂的兄长明楼兄弟同心，启动“丧钟敲响”行动，成功用虚假情报迷惑了日军，为抗战最终胜利赢得了转机。不同于一般电视剧的剧情线路，《伪装者》开篇集中铺展了错综复杂的人物关系，以及每一个角色或明或暗的多重身份，独独对男女主角的感情线秘而不宣。昨晚，胡歌饰演的男主角明台终与王乐君饰演的女主角程锦云首次相遇，却遭遇导演李雪客串的日本小队长“横加刁难”，导演加男女主角戏里首次碰面，成就了一出精彩的暗潮汹涌+英雄救美。
电视剧《伪装者》的开篇，集中铺展了错综复杂的人物关系，以及每个角色或明或暗的多重身份，多条线索、多个悬念层层递进，却没有像以往一般，从开始就将男女主角的感情线曝光，而是随着剧情的推进，让两个处在不同阵营、毫无关系的人，通过巧妙的剧情设计联系在一起。王乐君饰演的程锦云是中共地下党员，伪装成日本医生登上日军的樱花号列车执行任务，此时胡歌饰演的明台亦是刚从军校毕业，以军统特工的身份，带着同样的任务伪装成列车员登上樱花号，两人自然而然便开始了一场不打不相识的初遇。
明台与程锦云如此特殊的“情侣”身份，成为了在这部拼智慧，拼胆量，拼热血、又身份复杂多变的谍战戏中一道“柔和”的风景线。让一向冠以“只有剧情好看”的抗日题材影视剧成为了一部十分“漂亮”的抗战大戏。剧中两人的爱情之路十分曲折，以性格、职业、类别反差极大的伪装者形象示人，所有“身份”都是组织赋予的，与真实的自我相差甚远，而唯一属于自己，能表达内心真实感受的只有两人之间这段两情相悦的感情，可谓是真正意义上的 “真爱不伪装”。最后结局中，程锦云使明台加入了共产党，并且在国民党内部继续担任特务，而明台屡立奇功，最后程锦云和明台走在了一起。