《惊天谜案》打出的旗号是“国内首部侦探悬疑推理剧”，导演刘新表示，3年磨一剑，就是为了拍出一部中国式的推理剧。
该剧从筹备到拍摄，共用了3年时间，光是剧本，就修改了30多遍，每个细节都经过反复推敲。拍摄过程中更是举全剧组之力，“我们经常边拍边商量，经常拍到中间就把之前的结局否定了，重新来设计，可以说这部戏是大家一起完成的”。
爱看美国电影与美剧的他直言拍摄中也借鉴了《七宗罪》、《越狱》等作品，比如剧中的七兄弟就有点《七宗罪》的“影子”——七兄弟曾生死与共，但因一本名为《不死鸟》的惊悚连载小说，陷入恐怖离奇死亡预言之中，人人自危，相互猜忌。预言死亡的《不死鸟》颇似《死亡笔记》，死亡案件的接踵发生又让人联想到《死神来了》，“谁是最后的凶手，看到最后一集才可能明白，漏看一集可能就会断了线索”，刘新自信能与国内以往类型剧区别开来。
冯远征则表示自己饰演的这位探长，不像福尔摩斯那般严谨，也不像保罗那般幽默，“他是疯狂的”。