引起酮症酸中毒
生酮减肥是一个非常流行的减肥方法，在理论上它是以避免葡萄糖的生理学代谢方式，从而改变酮体为关键的能量来源。如果一天中摄入的碳水化合物少于20克时，大约需要一周的时间，肝脏里面就会转换为消耗脂肪，进而产生这种物质，可以作为人体新陈代谢的动力。
可是当酮的数量越来越多时，代替葡萄糖的成分就会越来越明显，而大脑的动能来源于这个物质，人体内的血液中酮体，就可能会偏高，因此就容易引起酮症酸中毒的反应。
损伤肾脏
生酮饮食虽然可以燃烧脂肪，短期内体重看似明显下降，但其实这是伴随着大量脱水所呈现的假象。酮体首先出现在血液，其次是尿液，一旦有生酮现象出现时必须饮用足量的水分，将酮体经由肾臟尿液排出，否则会对肾臟功能产生损害，恐引发泌尿系统等问题。然而当酮排出体外时，会同时带走大量的水分，造成细胞脱水。
引起肌肉消耗症
生酮减肥法无法摄取足够的人体必需营养素，例如维生素、矿物质、纤维、抗氧化剂、植物化学物质。尤其是患有心臟病或糖尿病者更应该特别留意，最好不要轻易尝试。在分解脂肪的同时，肢体肌肉也会被分解消耗，终至肌肉消耗症，例如控制不良的糖尿病患者除了会出现酮症之外，四肢体肌肉更是会明显减少。
引起心血管疾病
生酮饮食中强调限制碳水化合物和蛋白质，对脂肪没有限制，号称吃到满足食欲为止，这种饮食法因为摄取过多的油脂，对心臟血管的健康会造成极大的负担。其是患有心臟病或糖尿病者更应该特别留意，最好不要轻易尝试。
生酮减肥是目前非常火爆的减肥方法，因为它采用了独特的饮食结构来达到燃烧脂肪的目的，但是这种方法也有可能会出现上面的弊端，所以大家要尽可能根据自己的实际情况来选择对的减肥方法，而运动永远是最安全经济的减肥选择。