淡水珍珠与海水珍珠（以南珠为例）的养殖技术是不同的，因此结构也有所不同。淡水珍珠是无核的，所有的成分由珍珠质组成，因此若以淡水珍珠制成珍珠粉，不存在其它杂物。
淡水珍珠与海水珍珠（以南珠为例）的养殖技术是不同的，因此结构也有所不同。淡水珍珠是无核的，所有的成分都由珍珠质组成，因此若以淡水珍珠制成珍珠粉，不存在其它物质混杂。而海水珍珠是有核的，其核一般由猪蹄蚌的贝壳磨成，珍珠质仅覆盖于表面，厚0.1~0.3毫米，生长期1年左右（淡水珠达4~5年），因此海水珍珠外围的珍珠质较薄，若以海水珠全部磨粉，则其中只有少量的珍珠质，大部分是贝壳粉，所以药用或美容效果不好，但如果海水珍珠要加工成100%的珍珠粉，必须先去掉内核，成本很高，也不易加工。
另外，海水珍珠多因有内核，其形状比较好控制，大多都比较规则，所以用做装饰品或手饰价值会更高，只有少部分不规则无装饰价值的海水珍珠用来做珍珠粉，所以海水珍珠粉的产量也不高。在药典中，海水珍珠和淡水珍珠是可以同等入药的。科学分析发现，淡水珍珠与海水珍珠的成分是有区别的，淡水珍珠有3种氨基酸含量较海水低，2种与之持平。
外用珍珠粉功效
一、美白，自然白皙透出来。
珍珠自古流传美白功效，现代科学发现，珍珠中微量元素能促进SOD的数量增加，活性增强，硒是制造谷胱甘肽过氧化物酶的主要物质，这种酶与SOD一样能清除自由基，改善肤色。珍珠粉美白需要内服外用配合，效果才能显现。
二、控油，还肌肤一片素净。
夏日炎炎，脸上油光闪闪，相信大多数爱美女性都有这个烦恼。推荐天然纳米珍珠粉。纳米珍珠粉粒径极细，所以表面积很大，有极好的吸附能力，可以将多余油脂吸附在其上。同时它也有收敛作用，可以控制油脂分泌让皮肤干爽清洁。
三、祛痘，只要青春不要痘。
珍珠粉可以清热解毒，清洁皮肤，控制油分，还可促进受损组织再生恢复。内服可清热解毒，内服外用相结合，对付痘痘十分有效。
四、淡斑，净白回归美丽重现。
《本草纲目》早就明确指出：“珍珠，除黑黯”， 珍珠粉中所含的大量微量元素可以有效遏止过氧化脂的增加，从而有效去除三大斑。
五、生肌，修复创口不留痕迹。
珍珠粉对皮肤的外伤（刀伤、烧伤、烫伤等）具有较好的修复作用。