输尿管位于腹膜后，为一肌肉粘膜所组成管状结构，上起自肾盂，下终止于膀胱三角。男性管长为27-30厘米，平均为28厘米；女性管长为25-28厘米，平均为26厘米。右侧短于左侧约1厘米。临床上将输尿管分为上、中、下三段，也可称为腹段、盆段、膀胱段：腹段自肾盂输尿管交界处，到跨越髂动脉处。盆段，自髂动脉到膀胱壁。膀胱段，自膀胱壁内斜行至膀胱粘膜、输尿管开口。 右侧输尿管腹段，在腹膜后沿腰大肌前面下降，然后通过肠系膜根部及回肠末端进入盆腔，其开始部分，位于十二指肠下降部及横部后方，在十二指肠和空回肠系膜之间。
这一段输尿管，由精索右结肠及回结肠血管在其前面越过，在髂窝中则与阑尾相近。因此，盲肠后位的阑尾炎，常引起右输尿管炎，在尿中可出现红细胞及脓细胞。输尿管盆段及膀胱段占据整个输尿管全长的一半，在髂总动脉前方通过盆腔边缘，然后在髂内动脉及腹膜之间达到膀胱底部，男性在输精管之后与输精管交叉进入膀胱。输尿管膀胱段在进入膀胱时和膀胱成一钝性角度，然后斜行向下，向内通过膀胱壁层后，在膀胱三角区，输尿管间脊外侧端开口。左右两个管口彼此相距约2.5厘米。输尿管粘膜和膀胱粘膜是彼此相连的，输尿管纵行肌与膀胱三角区肌亦是相连的。