菊花枯萎病是真菌性病害。病原菌为菊花尖镰孢菌，为一种土传病害。发病最适宜的温度为27℃-32℃，在21℃时病害趋向缓和，到15℃以下时则不再发病。近年尤其中一些要控制花期而进行遮光处理的菊花，因为棚内气温高，不通风，较易诱发此病。
该病菌感染植株时，最初表现为下部叶片失绿发黄，失去光泽，一般不易觉察。接着植株叶片开始萎蔫下垂，变褐，枯死，尤其是下部叶片也开始脱落。回此在植株刚开始遭受现出症状时，一定不要轻易认为是缺水，而延误防治。要仔细观察，并察看植株基部茎杆是否微肿变褐，表皮粗糙，间有裂缝，湿度大时可见白色霉状物。茎秆横切或纵切，可见维管束变褐色或黑褐色。也可将植株脱盆，可以看到被病菌侵染的根部变黑腐烂。
菊花枯萎病在预防时，一是选择搞病品种，并从无病菌植株上采集枝条繁殖。二是进行土壤消毒，定期用杀菌剂杀菌。三是控制土壤含水量，宜选用排水良好的基质。四是掌握植株密度，以便于通风。
而在植株被病菌感染时，一定要迅速施药。笔者在发现该病时，用50%多菌灵进行治疗，效果不错，方法如下：在植株出现病情时，配制多菌灵200倍-400倍液，溶液呈乳白色即可，植株根部浇灌，并喷洒全株。开始第一天、第二天连续两次，第四天一次，第六天一次，一般情况下，用四五次药即可恢复。但一些重病植株，一定要拔除，最好烧掉。